白芥子化痰后痰液可能通過呼吸道纖毛運動排出、被吞噬細胞分解、經消化道代謝、隨體液循環過濾、部分殘留于肺泡中。白芥子可通過促進纖毛擺動、刺激巨噬細胞活性、稀釋痰液黏度、調節黏液分泌、改善局部微循環等方式化解痰液。
呼吸道黏膜的纖毛通過定向擺動將痰液推向咽喉部，白芥子中的硫代葡萄糖苷可增強纖毛運動頻率。化解后的痰液混入唾液后被吞咽或咳出，每日約可清除10-100毫升黏液。
肺泡巨噬細胞能吞噬痰液中的顆粒物和病原體，白芥子揮發油可激活巨噬細胞TLR4受體。被吞噬的痰液成分在溶酶體內分解為氨基酸、糖類等小分子物質參與代謝。
吞咽入消化道的痰液經胃酸變性后，其中粘蛋白被胰蛋白酶分解為肽類。痰液中的電解質和水分在腸道被重吸收，殘余固體成分隨糞便排出體外。
痰液中可溶性物質通過肺泡毛細血管進入血液，經腎臟過濾后形成尿液排出。白芥子烯丙基異硫氰酸鹽可降低血液黏稠度，促進代謝廢物清除效率。
少量痰液成分可能暫時附著于肺泡表面活性物質層，需多次呼吸道清潔才能完全清除。長期吸煙者肺泡內可見含黑色素的巨噬細胞聚集，提示痰液殘留可能。
配合白芥子化痰期間建議每日飲水1500毫升以上，可進行腹式呼吸訓練增強膈肌運動，食用白蘿卜、銀耳等潤肺食材。若出現痰中帶血、鐵銹色痰等異常情況需及時進行胸部CT檢查，慢性支氣管炎患者可考慮霧化吸入乙酰半胱氨酸輔助排痰。
