中藥不建議使用微波爐加熱，傳統煎煮或隔水加熱更符合藥性保存要求。微波不均勻加熱可能導致有效成分破壞，金屬器皿易產生火花，塑料容器可能釋放有害物質。
微波高頻震蕩會使中藥極性分子劇烈運動，部分熱敏性成分如揮發油、苷類物質易分解。例如含薄荷、廣藿香的方劑加熱后藥效降低30%以上，阿膠等膠類藥材可能發生蛋白質變性。
微波加熱存在熱點效應，容器邊緣溫度可達90℃而中心僅40℃，導致藥液濃度差異。臨床觀察顯示小柴胡湯微波加熱后黃芩苷含量波動達25%，傳統水浴加熱溫差控制在5℃內。
含金屬成分的煎藥袋或錫箔包裝可能引發電弧放電，聚乙烯塑料瓶加熱60℃以上會釋放雙酚A。建議使用耐熱玻璃器皿，但中藥沉淀物附著后易造成局部過熱碳化。
部分需久煎的礦物類藥材如石膏、磁石，微波快速加熱難以析出有效成分。對比實驗顯示微波加熱30分鐘的牡蠣湯鋅溶出率僅為砂鍋煎煮的60%。
冷藏藥液可置于陶瓷碗隔水蒸10分鐘，濃縮藥膏建議50℃以下溫水融化。醫院代煎藥采用專業恒溫提取設備，家庭可用電藥壺保持70℃恒溫復熱。
服用中藥期間建議搭配粳米粥、山藥羹等易消化食物，避免劇烈運動影響氣血運行。藥液儲存需避光密封，冷藏不超過7天，加熱后藥渣可外敷穴位增強療效。體質虛弱者服藥后宜靜臥30分鐘，配合八段錦等舒緩運動促進藥物吸收。
