二十六味通經散需避免與抗凝藥物、激素類藥物、強心苷類藥物、單胺氧化酶抑制劑及含相同成分的中成藥合用，以防藥物相互作用導致療效降低或不良反應增加。
1、抗凝藥物：華法林、阿司匹林、氯吡格雷等抗凝藥物與二十六味通經散同用可能增加出血風險。該散劑中的活血化瘀成分可能增強抗凝效果，導致皮下瘀斑、牙齦出血等癥狀。用藥期間需監測凝血功能，必要時調整劑量。
2、激素類藥物：潑尼松、地塞米松等糖皮質激素與散劑聯用可能誘發消化道潰瘍。散劑中的部分成分可能刺激胃黏膜，與激素的黏膜損傷作用疊加，表現為腹痛、黑便等癥狀。建議間隔2小時以上服用。
3、強心苷類：地高辛、西地蘭等強心藥與散劑存在配伍禁忌。散劑中的某些生物堿可能增強強心苷毒性，引發心律失常、惡心嘔吐等洋地黃中毒癥狀。聯合使用時應密切監測血藥濃度。
4、單胺氧化酶抑制劑：異卡波肼、苯乙肼等抗抑郁藥與散劑同服可能導致血壓驟升。散劑含酪胺類物質，與單胺氧化酶抑制劑合用易引發高血壓危象，出現頭痛、心悸等癥狀。用藥間隔需超過14天。
5、相似功效中成藥：益母草顆粒、少腹逐瘀丸等活血類中成藥與二十六味通經散聯用可能造成藥效疊加。相同作用機制的藥物聯合使用會過度刺激子宮收縮，導致經量過多或周期紊亂，建議單一用藥。
使用二十六味通經散期間應保持飲食清淡，避免辛辣刺激食物影響藥效吸收。適度進行八段錦、太極拳等舒緩運動有助于氣血運行，但需避免劇烈運動加重出血風險。服藥后出現皮膚瘙癢、呼吸困難等過敏癥狀應立即停藥就醫，長期服用者每3個月需復查肝腎功能。
