小兒珠珀散需避免與鎮靜類藥物、含相似成分的中成藥、抗凝藥物、強效利尿劑及部分抗生素合用，具體禁忌藥物包括苯巴比妥、復方丹參片、華法林、呋塞米、阿奇霉素等。

小兒珠珀散含朱砂等鎮靜成分，與苯巴比妥、地西泮等中樞抑制劑聯用可能增強鎮靜作用，導致嗜睡或呼吸抑制。兒童神經系統發育不完善，藥物相互作用風險更高。

復方丹參片、安宮牛黃丸等中成藥同樣含有朱砂，合并使用可能造成汞蓄積中毒。表現為牙齦紅腫、腹痛等癥狀，長期使用會損傷肝腎。

華法林、阿司匹林與珠珀散聯用可能干擾凝血功能。珠珀散中琥珀具有活血化瘀作用，與抗凝藥協同效應會增加出血風險，如鼻衄或皮下瘀斑。

呋塞米、氫氯噻嗪等藥物會加速電解質排泄，與珠珀散中礦物質成分相互作用可能誘發低鉀血癥。患兒可能出現肌無力、心律失常等表現。

阿奇霉素、克拉霉素可能影響珠珀散代謝，導致藥物濃度異常升高。兒童肝酶系統未發育成熟，更易出現惡心、嘔吐等消化道不良反應。

使用小兒珠珀散期間應監測血常規及肝腎功能，避免與禁忌藥物同服。飲食宜清淡，適當補充富含維生素C的獼猴桃、鮮棗等水果，減少重金屬吸收。服藥后觀察患兒精神狀態與排便情況，出現異常立即停藥就醫。