正畸治療前需進行牙周治療可能由牙周炎癥、牙齦增生、牙槽骨吸收、牙齒松動、咬合創傷等因素引起，可通過齦上潔治、齦下刮治、牙周手術、藥物治療、咬合調整等方式干預。
牙齦炎或牙周炎會導致牙齦紅腫出血，正畸托槽粘接可能加重感染。基礎治療包括超聲波潔治清除菌斑，配合氯己定含漱液控制炎癥，嚴重時需局部應用米諾環素凝膠。
長期慢性刺激或藥物因素可能引發牙齦過度生長，影響托槽放置。通過牙齦成形術修整軟組織輪廓，苯妥英鈉相關增生需調整基礎用藥。
中重度牙周炎可能導致牙槽骨高度降低，正畸力可能加速牙齒松動。需進行引導性組織再生術結合骨粉植入，治療后可觀察到骨密度改善。
牙周袋深度超過5毫米的患牙存在Ⅱ度以上松動，可能與牙周韌帶破壞有關。采用牙周夾板固定松動牙，聯合多西環素抑制基質金屬蛋白酶活性。
早接觸或干擾可能加重牙周組織負擔，正畸移動牙齒前需調磨干擾點。使用咬合紙定位后選擇性調頜，深覆頜病例需配合平面導板。
牙周基礎治療是正畸前必要準備，日常需使用巴氏刷牙法配合牙線清潔，避免吸煙及高糖飲食。定期復查牙周探診深度，正畸期間建議每3個月進行專業牙周維護，選擇含氟牙膏和沖牙器輔助口腔衛生管理。牙周狀況穩定后，正畸治療可降低牙齦退縮等并發癥風險。
