非淋菌性尿道炎和淋病可通過病原體類型、癥狀表現、潛伏期長短、檢測方法及治療方案進行區分。非淋菌性尿道炎多由衣原體、支原體感染引起，淋病則由淋球菌導致。
非淋菌性尿道炎主要病原體為沙眼衣原體占50%和生殖支原體占30%，其余可能由陰道毛滴蟲等引起。淋病病原體為淋病奈瑟菌，屬于革蘭陰性雙球菌，兩者微生物學特性完全不同。
非淋菌性尿道炎表現為尿道刺癢伴少量稀薄分泌物，晨起尿道口可見"糊口"現象。淋病急性期出現黃色膿性分泌物、排尿灼痛，嚴重者伴隨發熱等全身癥狀。兩者均可引起附睪炎等并發癥，但淋病病程進展更快。
非淋菌性尿道炎潛伏期1-3周，癥狀發展緩慢。淋病潛伏期僅2-5天，起病急驟，部分男性患者24小時內即出現典型癥狀。潛伏期差異是臨床鑒別的重要依據。
非淋菌性尿道炎需采用衣原體抗原檢測或支原體培養，核酸擴增技術如PCR靈敏度最高。淋病診斷依靠分泌物革蘭染色鏡檢見白細胞內雙球菌或淋球菌培養，分子生物學檢測可同步鑒別兩種病原體。
非淋菌性尿道炎首選多西環素、阿奇霉素口服，療程7-14天。淋病需頭孢曲松聯合阿奇霉素雙藥治療，耐藥菌株需根據藥敏結果調整。兩者性伴侶需同步治療，治愈后均需復查病原體。
日常需注意避免無保護性行為，治療期間禁止飲酒。非淋菌性尿道炎患者建議每日飲水2000ml以上，淋病患者需嚴格消毒個人用品。兩者均可通過規范使用避孕套預防，出現泌尿系統癥狀應及時進行尿常規、病原體檢測等篩查，確診后需完成全程足量藥物治療，避免自行停藥導致慢性化或耐藥性產生。
