杭菊與部分藥物合用可能產生相互作用，影響藥效或增加不良反應風險。常見需避免合用的藥物包括抗凝藥、降壓藥、鎮靜劑、降糖藥及部分抗生素。
1、抗凝藥物：杭菊含黃酮類物質可能增強華法林、阿司匹林、氯吡格雷的抗凝作用，增加出血風險。服用這類藥物期間需監測凝血功能，避免大量飲用菊花茶。
2、降壓藥物：杭菊的降壓特性可能協同鈣通道阻滯劑氨氯地平、血管緊張素轉換酶抑制劑卡托普利的作用，導致血壓過度下降。建議間隔2小時服用并定期測量血壓。
3、中樞抑制劑：杭菊鎮靜成分可能加強苯二氮?類地西泮、巴比妥類藥物的中樞抑制作用。合用易出現嗜睡、注意力下降，駕駛員等需慎用。
4、降糖藥物：杭菊多糖成分可能增強胰島素、二甲雙胍的降糖效果，增加低血糖風險。糖尿病患者聯合使用時需加強血糖監測，必要時調整藥物劑量。
5、抗生素類：杭菊中的有機酸可能影響喹諾酮類左氧氟沙星、四環素類藥物的吸收。建議服藥前后2小時內避免飲用菊花茶，以保障抗生素療效。
日常飲用杭菊時需注意控制每日用量，干品建議不超過10克。高血壓、糖尿病患者應咨詢醫師調整飲食與藥物方案，避免空腹飲用。運動前后適量補充電解質可減少可能出現的乏力感。長期服用處方藥者建議定期復查肝腎功能，出現頭暈、心悸等不適及時就醫。
