治療瘊子的藥膏有水楊酸軟膏、氟尿嘧啶軟膏、咪喹莫特乳膏等，可通過局部腐蝕、抗增殖或免疫調節作用去除疣體。

水楊酸軟膏通過溶解角質層蛋白使疣體脫落，適用于體積較小的尋常疣。使用時需避免接觸正常皮膚，每日涂抹1-2次，連續使用4-6周可能出現局部刺痛或脫皮。

氟尿嘧啶軟膏抑制病毒DNA合成從而消除疣體，對扁平疣效果顯著。該藥物可能引起色素沉著或皮膚潰瘍，孕婦禁用。建議晚間薄涂患處并用繃帶覆蓋。

咪喹莫特乳膏通過激活局部免疫反應清除HPV感染，適合生殖器疣治療。每周使用3次需按摩至吸收，可能出現紅斑、水腫等免疫反應，療程不超過16周。

維A酸類藥物調節表皮細胞分化，對頑固性跖疣有效。使用期間需嚴格防曬，避免與脫毛劑等刺激性產品同用，常見副作用為干燥脫屑。

鬼臼毒素通過細胞毒作用破壞疣體組織，需由醫生操作點涂。治療后48小時內保持創面干燥，可能出現劇烈疼痛或潰瘍，禁止用于面部及大面積皮損。

藥物治療期間建議穿著透氣棉襪避免摩擦，每日用碘伏消毒周圍皮膚。飲食可增加富含維生素A的胡蘿卜、動物肝臟促進皮膚修復，適當進行快走、游泳等增強免疫力。若疣體增大、出血或經2個月治療未消退，需及時就診接受冷凍、激光等物理治療。