腦肽膠囊需避免與抗凝藥物、鎮靜催眠藥、單胺氧化酶抑制劑、免疫抑制劑及含相同成分的中成藥合用。合用可能引發藥物相互作用，導致藥效增強或減弱，甚至產生不良反應。
1、抗凝藥物：
腦肽膠囊中的活性成分可能影響血小板功能，與華法林、阿司匹林等抗凝藥物合用時，可能增加出血風險。兩類藥物均通過不同途徑干擾凝血機制，聯合使用需嚴格監測凝血功能。
2、鎮靜催眠藥：
腦肽膠囊具有一定中樞調節作用，與地西泮、艾司唑侖等鎮靜藥物合用可能過度抑制中樞神經系統，導致嗜睡、呼吸抑制等不良反應。老年患者尤其需警惕疊加效應。
3、單胺氧化酶抑制劑：
與異卡波肼、司來吉蘭等抗抑郁藥合用可能引發5-羥色胺綜合征，表現為高熱、震顫等癥狀。腦肽膠囊中的氨基酸類成分可能影響單胺類神經遞質代謝。
4、免疫抑制劑：
環孢素、他克莫司等藥物與腦肽膠囊合用時，可能因代謝酶競爭導致血藥濃度異常。免疫調節功能可能被干擾，增加感染或排斥反應風險。
5、同類中成藥：
避免與復方丹參滴丸、銀杏葉提取物等改善腦循環的中成藥聯用。功效成分重疊可能引發過度擴血管效應，導致頭痛或低血壓。
使用腦肽膠囊期間應保持規律作息，避免高脂飲食影響藥物吸收。服藥前后兩小時不宜飲用濃茶或咖啡，以免影響成分代謝。合并慢性病患者需定期復查肝腎功能，出現心悸、皮疹等不適及時就醫。建議用藥前向醫師詳細說明當前用藥史，包括處方藥、保健品及中藥制劑。
